Если через "КриптоПро" не проходит проверка, это тревожный звоночек. Удостоверяющие центры должны быть аккредитованы Минцифры, иначе подпись юридически ничтожна. Проверьте список аккредитованных УЦ на
https://gov.ru/. Если центра нет, значит подпись недействительна в рамках госдокументооборота.